Die NÖ Landesregierung hat mit Bescheid vom 3. Dezember 1991, Zl. II/1-M-502-91, gemäß § 4 Abs. 1 der NÖ Gemeindeordnung 1973, LGBl. 1000–6, der Gemeinde Muggendorf das nachstehend beschriebene Gemeindewappen verliehen:
“In grünem Schild erniedrigt ein silberner Wellenbalken, darüber ein springender Hirsch mit achtendigem Geweih, im Schildfuß eine goldene Sapine schräg gekreuzt mit einer goldenen Hacke.”
Gleichzeitig wurden gemäß § 4 Abs. 4 der NÖ Gemeindeordnung 1973 die vom Gemeinderat der Gemeinde Muggendorf festgesetzten Gemeindefarben “Grün-Gelb” genehmigt.